目前摩托车发动机结构形式主要是单缸机，双缸机（V和L以及H），三缸机（L3）以及四缸机(L4和V4)，五缸六缸的也有，但是不多。比如金翼和GTL1600。
汽车发动机的结构形式基本都是L4较多，也有2缸和3缸的，以及4/5/6/8/10/12/16等，因为是多缸，排列形式主要是L,V,H形排列。
冷却方式上，摩托车主要是风冷，油冷以及水冷，汽车到目前来说基本全是水冷，保时捷的个别老爷车有风冷。
燃油供应方式上，目前汽车基本100%实现了燃油注入(Fuel Injection)，俗称电喷，摩托车大贸的基本全线%的国内产品都还停留在单缸化油器时代。
动力方面，一般摩托车偏向于提高功率，汽车一般偏向于提高扭矩。汽车发动机(仅讨论自然吸气发动机)一般最大扭矩在3500-5000转爆发，最大功率在6000转左右达到，而摩托车在扭矩和功率上要达到最大扭矩和功率所需的转速都更高。一般汽车发动机的转速很少超过7000转，但是摩托车4缸机超过20000转都是有的。
一般来说，排量相同的情况下，气缸数越多，低转速扭矩越差，高转速功率越大，反之亦然。
目前的国产摩托车发动机，还没有一款是完全具有自主知识产权的，基本清一色仿本田CG，铃木GS，也有仿CB和雅马哈YB的，几十年基本没什么变化，倒是质量越来越差。
下面列一下当前国际上比较有名的摩托车发动机，汽车的就不列了，基本主流的L4/V6/V8不难找。
4、YAMAHA R6的L4发动机。日系四大家族L4发动机技术都非常了得。
[当时，本田赛车公司已经生产出了123ml直列四缸的RC146，面对咄咄逼人的对手，已是力不从心。赛车的极速从哪里来？当然是转速，转速越高功率就越大。在排量相同的前提下，如何有效提升转速来最大化地压榨功率？增加气缸数量则是最可行的方案了。于是，本田突破了125ml级发动机的缸数极限，丧心病狂地打造出了5缸GP版RC148。这是一台凝聚了本田技术精华的超级发动机，缸径和冲程为33×29毫米，总容量为124ml，每缸四气门的配气凸轮轴驱动器在三缸和四缸之间，最高转速突破20000rpm，最大功率超过了34马力，最高速度达210km/h！除了缸数令人吃惊，挡位的数量也让人大跌眼镜——技师为其设置了8个挡位。可以想象，想要骑好这辆净重只有85公斤的8挡小车不是一件容易的事情，更遑论在激烈竞争的复杂赛道上狂奔了，哪怕它的前制动采用了双蹄片鼓刹，坐在这辆窄窄的小车上高速奔跑如强风中飘落的柳叶，也是一场拿生命做赌注的冒险。]
确实有直接把汽车发动机搬到摩托车上的，比如某辆使用v10蝰蛇发动机的神经病产物：
但绝大部分时候，摩托车全车的重量也不如一台汽车发动机，体积上也不能承受。
2，摩托车的发动机偏向高转速，主要追求马力，汽车发动机偏向低转速，主要追求扭矩
很容易理解这种设计上的区别，摩托车轻轮窄，扭矩需求小，汽车不光重，接触地面的面积也大，需要更多扭矩。
以上两点在宝马的摩托车汽车发动机上有所体现，k1600gt/gtl用的发动机据说和汽车上的著名直六一脉相承，K1600GT在1700rpm左右就能输出115牛米的扭力，而宝马正宗的超跑S1000RR 转速要拉到11000转才输出111牛米扭力。k16的表现一定程度上源于它的设计目的，但是想必也有从它的汽车发动机原型上继承得来的属性。
至于具体的技术，在确定了设计取向之后才有应用的意义。我们耳熟能详的几个重要技术比如本田的vtec，比如单点电喷多点电喷乃至缸内直喷，比如宝马常玩的水平对置，其实在汽车上都有应用，有的根本就是来源于汽车发动机。所以你要我说的话，对于技术上存在合作的同一个厂商内部的摩托车汽车部门，不存在技术上的区别，只存在是否应该应用可以应用于特定车型的区别。
汽车发动机与变速器、离合器是分开润滑的，曲轴箱内的机油温度约在75～90C之间；而四冲程摩托车发动机中包括离合器（踏板车和部分性能车使用的干式离合器除外）、高速及变速器齿轮、换挡机构以及活塞、气缸、进排气阀等运动零件都在同一结构体内，共用同一容积内的机油。
再具体说，1999年以后生产的采用湿式多片离合器的摩托车不能使用汽车机油，因为离合片在那之后不能使用石棉材料，含钼的机油会造成离合片打滑。
缸径越大，活塞的行程就短。有利于提高发动机的转数，进而提高功率，但扭矩会减小。
常聽到的是250、400cc的越野摩托車使用大單缸，扭力超強但卻跑不到200km/h,
小黃蜂250、或是600等級進口4缸仿賽摩托，4缸發動機，低轉提速沒力，必須拉高轉才有衝力，但可輕易上200km/h
你問玩過車的人600單缸跟600四缸誰低轉提速有力，誰高轉功率大，相信答案是肯定的！
但為什麼實際上操作跟理論聽起來相反？ 600單缸是大缸徑，600四缸是小缸徑，但功率卻是小缸徑的大？扭矩是單缸的大？
原因在於一個前提：相同排量及汽缸數下，這理論才會成立！要同是600cc的兩個不同的單缸發動機比較，這理論就成立了！因為內燃機是靠爆炸產生動力，設定前提下，燃燒室的空間是固定的。大缸径短行程有利於迅速拉轉，但也代表沒有能量儲存的空間，所以扭矩峰值出現較早，一般３０００轉就到了最大扭矩了，開起來起步輕快但後段無力，有點未老先衰的感覺，上了高速就沒力...
乍看之下600單缸跟600四缸是同排量的車，實際上以單缸來看，600四缸的車上搭載的是150的汽缸x4組，想想，一個150當然不能跟一個600比較什麼叫缸徑大，行程長之類的問題！
一個壯漢跟四個普通人比搬運，壯漢肯定爆發力強，但是肯定不如四個人耐久，一樣的意思！
汽車因為重量重 所以必須搭載大排量大缸径的多汽缸發動機才能創造出足夠的扭力拖動車身（用四個以上的壯漢拖動車身）
摩托車因為重量輕, 所以對發動機的要求相較沒那麼嚴苛（用一個壯漢或是四個普通人就夠了）
就我们日常用的摩托车和买菜家用汽车来说，摩托车常用下置凸轮轴顶杆机，而汽车是顶置凸轮轴正时皮带。
波箱也不一样，摩托是序列波箱。摩托车体积小，而且没有更多的手换挡了，序列波箱更合适。
